Ойынның екінші бөлігінде сіз арнайы күштерде Америкадағы ірі қалалардың бірі үшін күресетін Alien Mutants 2 шабуылына қатысасыз. Мутантты монстрлардың соғысы қаланы басып алып, қазір адамдарды аңшылыққа алды. Сіздің отставкаға қала көшелерін жәндіктерден тазарту туралы бұйрық түсті. Тікұшақтан қонғаннан кейін сіздің кейіпкеріңіз және оның командасы қала арқылы қозғала бастайды. Қысқа сызықшаларды жылжыту үшін айналаңыздағы барлық нәрсені қадағалап, жауды іздеу керек. Сіз оны көрген кезде, қаруыңыздан атуды бастаңыз және оларды өлтіріңіз. Оқ-дәрілер мен алғашқы көмек жинақтарын жинауға тырысыңыз. Олар шайқаста аман қалуыңызға көмектеседі.
