Көптеген адамдар бар, олардың ішінде ғалымдар ғаламшарға ұзақ уақыт бойы келіп, жер бетінде өмір сүріп, олардың өміріне ықпал ететініне сенеді. Клоунс Vs Aliens ойынында планетаны басып алудың осындай сценарийіне жол бермей, Капитан Пэйси басқарған клоундарға көмектесе аласыз. Ол шетелдіктерді жою үшін түпнұсқалық арсеналды жинап, оны қорғаныс үшін пайдалануға шақырады. Қару сол жақ тік панелінде орналасқан. Бастау үшін сізге тек қара баллондар қол жетімді болады. Олар шабуылдардың алғашқы толқындарымен оңай күреседі. Одан кейін бізге қару қажет. Оларға шарлардың шкаласы толған кезде оларға қол жетімділік ашылады.
