Вирус Ninja 2 ойынының екінші бөлімінде сіз батыл ниндзя жауынгеріне түрлі вирустармен күресуге көмектесесіз. Экранда әр түрлі бактериялар пайда болатын ойын өрісі болады. Олар әр түрлі бағытта және әртүрлі жылдамдықпен қозғалады. Оларды жою үшін қылышты пайдалану керек. Экранға мұқият қарап, тінтуірдің көмегімен заттарды жүргізіңіз. Осылайша, сіз бактерияларға соққы беріп, оларды бөліктерге бөлесіз. Кейде бұл нысандар арасында бомбалар пайда болуы мүмкін. Сіз оларды бұрмаңыз.
