Осы уақытқа дейін Марио мәңгілік жауы Боузердің зұлым саңырауқұлақтарымен, ұлулармен және басқа да қызметшілерімен ғана күресуге мәжбүр болды. Бірақ бұл Super Mario Commander -де оны күтетін нәрсемен салыстырғанда гүлдер. Ғарыштан жасырын шабуыл Марио әлеміне күтпеген жерден жасалды. Тістеріне дейін қаруланған қорқынышты және зұлым жаратылыстар бір кездері бейбіт патшалықта бүлдірді. Марио байыпты қаруды алып, супер қаһарман рөлін ойнауға мәжбүр болады. Ал оның табысқа жетуі үшін сантехникке өзіне жаңа рөлді меңгеруге көмектес. Платформаларды ғарыштық қарақшылардан тазартып, Super Mario Commander -де әлемді қайтадан жерге қайтару қажет.
