Ниндзя аяғын созып, тиын жинап қаланы айналып жүгіруді ұйғарды. Ninja Runner ойынында сіз кейіпкерді кездестіресіз және оған қалалық паркурды ұйымдастыруға көмектесесіз. Батыр үшін бағынбайтын биіктер жоқ, жігітті бірнеше рет басуға болады, ол кез келген шыңға секіреді: платформаға, мұнараға және басқа шыңға. Деңгейден өтіп, сіз басқа деңгейге ауыса аласыз, бірақ абай болыңыз, жаңа деңгейлерде өмірлік жүректерді жоғалтпау үшін секірудің қажеті жоқ өткір шыбықтар түріндегі қосымша кедергілер болады. Барған сайын өткір кедергілер бар, яғни Ниндзя жүгірушісінде ниндзяны өмірін жоғалтудан құтқару үшін сізге өте жылдам және епті болу керек болады.
